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內政部於11月做出函釋，在都更條例修法之前，就已申請事業計畫的都更案，只要依規定期限申請建照並依建築期限完工，就可以適用更新後房屋稅減半徵收延長10年，以及協議合建的稅賦減免優惠，讓已提出申請或程序中的都更案件也能享有其優惠，減輕地主負擔。

營建署指出，為鼓勵民眾參與都市更新，在今年1月30日修正發布都更條例，除了提供明確化的容積獎勵外，也修正都更條例第67條規定，延長更新後房屋稅減半徵收期限，以及增訂因協議合建辦理產權移轉，所產生的土地增值稅和契稅，可以減徵40%。

依照都更條例原有的規定，土地增值稅和契稅減免，有5年的實施限制，如此一來，有可能產生優惠期限屆滿，卻還沒有完成更新的案件，這樣的案件是否仍適用稅捐優惠，成為業者最大的疑慮。

營建署表示，為了保障在修法前，就已經申請都更的土地和建物所有權人，能享有新修法後的減免優惠，內政部作出明確解釋，讓已經在都更條例修正施行前，就已經提出申請，或是已核定但還沒有完成更新的都更案，也能夠適用都更條例第67條第3項，房屋稅及協議合建賦稅減免的規定。