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台南市政府表示，房屋標準價格經2016年不動產評價委員會重行評定並公告後，依法適用2017、2018及2019三年開徵房屋稅之徵收，未滿3年不得重行評定，換言之，法律效力是3年，不是任何行政命令可已更改的。

財政部2010年函釋規定新標準單價僅適用新房屋，造成使用執照發照日期前後僅相差1天，卻因適用不同標準單價，致每年應繳納稅額差距極大，產生一刀切之不公平現象，違反租稅公平原則，為解決此不公平現象，財政部才以2014年令廢止2010年函釋，各地方政府得視實際情形自行決定其適用原則。新舊房屋均享受相同公共建設服務，基於公平，不應因新舊房屋而有不同待遇，但舊屋因逐年折舊且按行政院營造工程物價指數折扣，所以舊屋的調幅較新屋小。

台南市政府強調，沒有補徵以前年度的房屋稅，是現行課稅事實的變更，沒有違反法律不溯及既往原則，也沒有違反稅捐稽徵法規定。