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總爺藝文中心的前身是「麻豆總爺糖廠」，在日治時期則是「明治製糖株式會社」，西元1906年由日本三菱集團發起成立，當時正值明治維新日本推動西化運動，因此在總爺藝文中心內留下的日式建築中，兼具日本傳統與現代的建築技術，也讓這些古蹟建築物更具價值，台南縣政府將這些古蹟建築列為縣定古蹟，使總爺藝文中心得以日式古蹟之美吸引遊客。

麻豆總爺糖廠經評定為縣定古蹟的面積達二點一六公頃，範圍包括紅樓辦公室、木構招待所、紅磚餐廳、木構社長宿舍、日式庭園及周邊的老樹，據地方文史工作者調查，三菱集團當初在打造總爺糖廠時，除在獲取製糖的利潤外，也將總爺糖廠打造成一處迎接日本官員的度假中心，因此對於糖廠的建築特別重視。

根據建築學家的研究，總爺糖廠的興建背景正是日本大量引進西方技術的明治維新時代，因此總爺藝文中心的古蹟建築物，可以看到日本傳統與西式建築的結合，其中招待所及社長宿舍都是傳統的木造日式房舍，但因台灣的氣候遠比日本潮濕，日本的建築專家就把木屋挑高，在木屋的基座內留下通氣孔，使濕氣不會回滲到屋內，並且成為冬暖夏涼的日式木屋。
紅磚餐廳及紅樓辦公室建築則可看到日本西化的足跡，尤其是紅磚餐廳是一座外型仿巴洛克式的建築，牆壁以紅磚砌成，屋頂結構是以木頭加上鋼索的拉力組合而成，集融合新、舊建築技術大成，受到現今建築學家的推崇。