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台南市捷運整體路網規劃經交通部核備後，並同意補助優先路網中鏈結南科、沙崙的深綠線可行性研究經費1500萬元，台南市政府期許透過捷運深綠線鏈結台南科技雙引擎，以強化產業群聚及引進人才打造台灣下一世代新護國神山，促使台南由文化古都躍升為科技新都。
 
交通局表示，捷運建設屬台南市重大交通基礎工程，賴清德副總統任台南市長時所擘劃促成的第一期藍線、藍線延伸線、綠線及紅線，刻正依程序積極推動規劃作業；另考量南科的快速發展及沙崙的發展潛力，未來針對府城、南科及沙崙三核心生活圈的交通鏈結優化日益重要，市長黃偉哲特別重視捷運深綠線，並指示交通局積極向中央爭取經費啟動規劃作業。

市府團隊與多位立法委員齊心加速推動捷運建設，並力邀立法院交通委員會與交通部於4月6日至台南考察捷運系統型式擇定及優先路網規劃進度，除獲交通部長王國材於肯定外並進一步表示支持台南捷運深綠線建設計畫，交通部5月9日同意捷運深綠線可行性研究1500萬元經費補助。

交通局表示，捷運深綠線預計南起藍延線BH01站(歸南里站、市道182)、行經高鐵橋旁(台39)至南科及週邊生活發展區，沿線包含歸仁、新化、新市及善化等行政區，實際路線將於可行性研究評估確認。
 
未來捷運深綠線建設完成後，除了提升台南科學園區及沙崙綠能科學城二地交通往返便利性，更可進一步強化府城、南科及沙崙三核心鏈結，除可解決未來產業發展所帶來的交通衝擊外，更提供產業科技人才的便利交流，並藉由捷運深綠線建設導入TOD發展，打造形塑科技生活廊帶繁榮地方發展，交通局已著手啟動並趕辦深綠線可行性研究作業，以期捷運深綠線建設早日推動實現。