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台南市長黃偉哲在市議會召開的定期會中答覆議員質詢，有關南台副都心的15公頃的文教用地規畫建設國立科學教育體驗未來館的進度問題，他表示本案業經教育部同意興建，將由中央撥款，並主導興建期程。

未來南台副都心預計將設置9.8公頃的之「國立科學未來館」，而市府表示已知目前進度是行政院已於108年12月11日函復教育部支持建立國立科學未來館，並請教育部辦理後續相關規劃設計。

而教育部業於108年12月24日函復台南市政府，委託辦理「國立科學未來館建置計畫」，台南市政府也已完成結案，教育部亦於109年度預算匡列4,697萬元，辦理本案設計規劃。

同年教育部於3月5日函請國立自然科學博物館孫維新館長擔任國立科學未來館籌備小組召集人，並由科博館成立籌備小組，由未來館籌備小組研提該館興建需求，完成「綜合規劃報告書」提送國發會核定工程經費。

本案預計由中央政府投入46.97億元（硬體設施25.94億元、軟體設施21.03億元），並預估每年將帶來超過140萬人次的參訪，若以每人消費1,500元的保守估計，概估每年可為台南帶來超過21億元的商機。