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台39線沿著高鐵橋下闢建，北從台南市新化區台20線，往南經歸仁區至高市阿蓮區台28線，於2017年開通，主要連結高鐵台南站，是南台南、北高雄民眾往來高鐵台南站的捷徑。台39線目前只開通到阿蓮段，阿蓮往南經路竹、岡山、燕巢、大社至仁武地區，全長約20公里並未開通。

台39線往南延伸具有健全地區路網功能，填補國道1號和3號間所缺的南北向主要幹道，可強化路網結構，並與省道台1線成為國1東西側重要平行替代道路，分擔南北向地區短程需求交通量。

交通部表示，國1岡山、楠梓路段平日車流壅塞不已，交通部曾考慮施作高架，但高架勢必要拆很多房子不可行，因此台39線往南延伸就成為選項之一，南北側各開2線道，以省道標準來做規劃，行車時速約70公里，台39線將串聯南科和橋科園區。

交通部已指示公路總局接手規劃，進行可行性評估，未來將經由整理規劃後分段實施，希望藉著台39線串聯台南高雄兩地的便利交通，也使南科與橋科之間的往返有另一種選擇。